我国绘制出首张微生物基因组“完成图”
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发布时间:2004-09-12 18:19:52
经过1年多的努力,我国科学家最近测定了一种嗜热菌的全部序列,准确率达到99.99%,从而获得了国内第一张微生物基因组“完成图”,标志着我国基因组研究又向前迈出重要一步。 据悉,这是迄今为止中国人首次破译微生物的遗传密码,嗜热菌也成为除病毒外国内第一个遗传密码被破译的微生物。 微生物是一大群小生物的总称,因其形体小而得名。投入少、收效快的微生物基因组研究,是当今世界基因组研究中的前沿领域。我国地理环境复杂,含有丰富的微生物资源,研究这些微生物,无论对于生物进化研究,还是特殊酶以及蛋白质的结构和功能研究都有重要意义。 1998年初,我国科研人员在云南腾冲地区考察时在沸泉中发现了一种泉生热孢菌,最适合在75度左右高温下生长。在进行分类、形态方面的研究后,研究人员发现,国内第一个被发现的这种极端嗜热菌,是国际上从未报道过的新菌种。 从1999年5月起,中国科学院遗传研究所、微生物研究所和生物物理研究所的科学家联合起来,开始测定这种嗜热菌的全基因组DNA(脱氧核糖核酸)序列。 科研人员从培养的细菌中提取了基因组DNA,构建了测序模板文库,还建立了反映测序进展与存在问题以及用于组装、注释、寻找基因的软件。在基因测序中,获得了单机日产、序列读长、准确率等指数与国际同行并驾齐驱的好结果。 截至目前,科研人员已测定这个微生物基因组的260多万个碱基对,基因组的准确率达到99.99%以上,从而获取了微生物基因组的“完成图”。科学家已发现了2808个基因,其中1481个是功能已知的基因,另外1327个基因的功能还不清楚。 研究表明,大约30个基因只能在嗜热的真细菌或古细菌中找到,这在科研和产业化上具有重要价值。这种嗜热菌和另外一种细菌――需氧芽孢杆菌的同源性最高为59.8%,进一步表明了这种细菌的“特殊性”。
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