如何制备结核杆菌探针?。。。。
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发布时间:2008-07-31 14:35:44
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1 材料和方法
1.1 一般资料
1.1.1 菌种和质粒 本研究所用分支杆菌标准菌株来源于中国药品生物制品检定所;大肠杆菌和质粒pUC19来源于军事医学科学院八所;星状诺卡氏菌由中科院微生物研究所提供。
1.1.2 工具酶 碱性磷酸酶为Boehringer产品,Klenow酶为New England Biolabs产品,其余均为华美生物工程公司进口分装品。
1.1.3 化学试剂 普通琼脂糖购自华美和北京中山生物技术有限公司,随机引物为Boehringer产品,[α-32P] dATP为Promega Biotech公司产品,其余试剂为国产分析纯。
1.1.4 硝酸纤维膜(孔径为0.45um) 北京化工学校和浙江黄岩人民化工厂产品。
1.2 方法
1.2.1 细菌培养 将受试分支杆菌和非分支杆菌接种于适当培养基上培养。
1.2.2 DNA分离、纯化 收集分支杆菌菌体,悬浮于2mg/ml溶菌酶溶液中,37℃孵育2h。加链霉蛋白酶E和SDS分别至终浓度1mg/ml和1%(w/v),在60℃孵育2h以上。用苯酚:氯仿抽提后,加乙醇离心沉淀,将沉淀溶解于适量的TE缓冲液中。质粒pUC19 DNA的分离、纯化参考Maniatis等[4]的方法。
1.2.3 限制性内切酶消化DNA和琼脂糖凝胶电泳 限制性酶切反应按照厂家推荐的方法进行,于65℃加热5min终止反应。以EcoRⅠ和HindⅢ消化的λ-DNA为对照,消化的DNA在0.7%或1.2%的琼脂糖凝胶电泳分离后,在紫外灯下观察、照相。
1.2.4 DNA片段的回收技术 通过电洗脱法回收。Bio-Rad电洗脱回收仪回收法:按厂家介绍的方法进行。透析袋回收法:参照刘宗正介绍的方法[5]。
1.2.5 重组质粒基因库的构建及筛选 用限制性内切酶PstⅠ消化人型结核杆菌H37Rv DNA,回收2~8Kb的DNA片段,按Maniatis等介绍的方法[4],与PstⅠ消化并经小牛肠碱性磷酸酶处理的载体pUC19重组并转化大肠杆菌JM83,用麦康凯培养基初步筛选转化子,获得的白色菌落用人型结核杆菌H 37Rv全染色体DNA探针通过DNA:DNA杂交反应进一步筛选阳性克隆。
1.2.6 探针标记技术
(1) 缺口翻译法:参考Maniatis等介绍的方法,取回收的DNA片段lμg左右,用[α-32P]dATP 30uCi进行标记,探针的比活性约为3-4×107cpm/μg.
(2) 随机引物法:由军事医学科学院八所方继明教授根据厂家推荐的方法建立。一般取回收DNA片段50~200ng,用[α-32P]dATP 20uCi进行标记,探针的比活性约为1010-1011cpm/μg。
1.2.7 制备DNA斑点杂交膜和菌落杂交膜 参照Bhattacharya[6]等介绍的方法制备。
1.2.8 杂交反应和放射自显影 杂交液中探针强度为107-1010cpm,杂交温度为37℃。杂交后置-20℃放射自显影6h~3d。
1.2.9 Southern转移 根据刘宗正介绍的方法[5],将DNA转移到硝酸纤维膜上(孔径0.45μm)与探针杂交。
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