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继美国人发明转基因技术并于８０年代引发第一次基因药物高潮之后，近年来解析人类基因组（人体碱基测序）的巨大成果正在掀起第二次基因医药技术发展高潮。美国在这个领域进行着开创性的研究开发活动，日本则以强烈的竞争态势向美国发起挑战。 基因医药技术包括ＤＮＡ芯片、基因疗法、针对每个人的不同体质使用最佳药物及用药量的个性化治疗方法以及基因药物。 ＤＮＡ芯片也叫基因芯片，这一技术最早是在美国发展起来的。它通过像集成电路制作过程中半导体光刻加工那样的缩微技术，在玻璃等基板上制作出上万种ＤＮＡ（脱氧核糖核酸）样品，然后通过对照的方法来识别测定基因的性质与功能，作为诊断疾病的一种手段。美国的ＤＮＡ芯片技术在全世界处于垄断地位，已达到商业化水平。宝酒造公司等日本企业从美国引进这一技术，目前也在生产和销售多种基因芯片。日立等８家企业实施联合开发，预定在２年后制造出产品来。 基因疗法是应用转基因技术，把特定的基因或病毒植入病灶细胞内治疗疾病的方法，它也是由美国首创。在美国，自１９９０年国立卫生研究所进行首例基因治疗以来，目前已有４０００人次接受了各种基因治疗，不过大约９０％都还处于临床试验阶段。日本是从１９９５年由北海道大学实施国内首例基因治疗的，目前主要由大学医学院进行，治疗对象涉及关节炎、肝硬化、心脏病、肺炎、前列腺炎、胰腺癌、血友病、肌肉发育代谢异常、食道癌、帕金森氏症、脑肿瘤、乳腺癌、肾细胞癌、闭塞性动脉硬化等多种疑难病症，但是它的关键技术，即把特定的基因和病毒植入患者细胞所必需的载体基本上是采用美国技术。面对着美国的几乎无法逾越的技术障壁，日本决心发展国产技术，摆脱美国技术对它的束缚。目前，日本已经开发成功了国产载体。 在迄今人体碱基测序和绘制基因组图谱方面，日本落在美国后面。但是在解析基因和蛋白质结构与功能，开发个性化医疗及基因药物等应用研究阶段，日本自认为与美国处于同一条起跑线上，因而显示了相当的决心与自信，决心要做到后来居上。然而实际情况却不容日本人乐观。 有资料说，以治疗生活习惯病为主要目标，美国正在开发的生物药品多达３６９种，而日本迄今仅仅开发出了３种。二者之间的差距可见一斑。 在解析决定个人体质的ＳＮＰｓ（单核苷酸多态性碱基）方面，美国塞莱拉公司宣称已解析了２１０万个ＳＮＰｓ，而日本却进展缓慢，日本政府计划在今明两年内解析１５万个ＳＮＰｓ。１９９９年，以解析白种人的ＳＮＰｓ为目标，美欧国家１０家制药公司已结成了联合研究组织。今年，日本４３家制药企业也实现大联合，组成研究共同体，解析日本人的ＳＮＰｓ。日本还与新加坡和蒙古进行合作，解析亚洲人、黄色人种的基因，确立它对有色人种基因医疗技术的垄断地位。 除了大企业，美国的风险企业，如生物基因、塞莱拉、因塞特等公司也在大举进入日本。它们以设立日本法人、进行技术合作和参加资本等手段与日本企业进行合作，收集日本人的基因数据，其目的是要占领日本这个世界第二大药品市场。 武田药品等日本的大制药公司也采取同样的手段，积极与美国的风险企业进行合作，在美国设立研究开发机构，企图获得美国的技术，挤进美国市场，占据一席之地。 在基因医疗技术领域，目前美日两国是既联合又竞争，既相互渗透利用又相互防范，形成了你中有我、我中有你的犬牙交错形势，不过从实力和实绩看，美国遥遥领先，日本要赶上美国，仍需时日。
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